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Rice and its unsuspected genetic diversity - CIRAD

水稻及其未知的遗传多样性

关键词:
来源:
CIRAD
全文链接1:
https://www.cirad.fr/en/news/all-news-items/articles/2018/science/rice-genetic-diversity
全文链接2:
类型:
学术文献
语种:
英文
原文发布日期:
2018
摘要:
3010个水稻品种的遗传多样性已经进行了分析。这项工作于4月25日在《自然》杂志上发表,由一个包括CIEAD在内的国际共同体所实施。该研究揭示了非常丰富的遗传多样性,特别是与不同品种的地理起源相关,并与作物的适应能力相关。在全球变化的适应是一个重大问题的时代,这是一个天赐良机。这些结果代表了最大的一组栽培物种基因组变异的文档。它们可以在开放存取中使用,使它们成为全世界养殖者的宝贵工具。解读水稻多样性对食品安全的影响水稻是世界上消费最广泛的主食,最近是一个非常广泛的基因分析的对象。3010个水稻品种的DNA已经进行了测序,并与2005年破译的参考品种Nipponbare进行了比较。这项研究是由包括CIRAD在内的大约15个组织的共同体于4月25日在《自然》杂志上发表的,由在北京的中国农业科学院和在菲律宾的国际水稻研究所(IRRI)协调。遗传多样性的新维度水稻已知具有非凡的适应性和农业形态多样性,但研究揭示了一种甚至几年前也未曾料到的多样性形式:基因含量变化。正如CIRAD的研究者和论文的共同作者Jean-Christophe Glaszmann所解释的:“在水稻中已知的24,000个基因家族中,只有60%被所有不同的品种共享,其他的可能存在或缺席,取决于品种。你可以想象这种多样性对物种适应能力的影响。这一知识为品种培育的新时代铺平了道路。通过基因组分析检测3010个品种CIRAD团队帮助将这项工作的结果付诸实践,最重要的是,选择待研究的品种。对此,Jean-Christophe Glaszmann在20世纪80年代在IRRI期间建立的水稻品种分类是非常宝贵的。该分类法后来成为育种工作者的参考,用于从总计超过80000种的IRRI收藏中选择品种。目的是获得现有多样性的代表性样本。所获得的新数据证实了分类的优点,并通过揭示地理上基本一致的子群来对其进行微调。我们现在看到的每个品种的基因组不是一个同质的整体,而是由几个独立的驯化事件造成的不同起源的拼凑,”研究人员补充说。开放存取数据这些结果代表了最大的一组栽培物种基因组变异的文档。这些数据是开放获取的,这使其成为全世界育种工作者的宝贵工具,不论其目的是分析水稻的适应能力还是更有效针对某些基因、基因家族或基因组构型进行品种改良,以可能进一步扩大适应范围。蒙彼利埃的科学团体,尤其是AGAP研究单位,可以特别从这些结果中受益,因为各个小组正在研究水稻生物多样性。这些结果也是为明天的生物学家和农艺学家建立培训业务的特殊基础,特别是通过在蒙彼利埃的LabEx Agro、Genome Harvest和CultiVar正在进行的旗舰项目。
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