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Genome-wide association study revealed that the TaGW8 gene was associated with kernel size in Chinese bread wheat

全基因组关联研究表明,TaGW8基因与中国面包小麦籽粒大小有关

关键词:
来源:
Nature
全文链接1:
http://agri.ckcest.cn/topic/downloadFile/57675c3b-cea2-4b17-8499-178649b1e5f7
全文链接2:
https://www.nature.com/articles/s41598-019-38570-2
类型:
学术文献
语种:
英语
原文发布日期:
2019-02-25
摘要:
利用小麦90k SNP(单核苷酸多态性)分析方法,以及GWAS(全基因组关联分析)对中国面包小麦的核相关性状在14个环境中进行关联定位。结果表明,4417和3172对籽粒长度和千粒重有显著影响的单核苷酸多态性中,996和953位于7B染色体上。通过对这些SNPs在7B上的单倍型分析,得到预测的TaGW8-B1基因。在面包小麦中通过测序进一步克隆了TaGW8-B1基因,在第一内含子中发现了276-bp 的InDel。不含276-bp索引的TaGW8-B1和带 276-bp索引的TaGW8-B1分别被命名为TaGW8-B1a和TaGW8-B1b。农艺性状分析表明,与TaGW8-B1b品种相比,TaGW8-B1a品种具有较宽的籽粒宽度、较高的穗粒数、较长的穗长、较高的千粒重和较多的小穗数。此外,TaGW8-B1a品种的产量显著高于TaGW8-B1b品种。因此,TaGW8-B1a被认为是一个潜在的优势等位基因。同时,经qRT-PCR检测,TaGW8-B1a在成熟种子中的表达水平明显高于TaGW8-B1b。这可能提示TaGW8-B1的高表达与面包小麦籽粒大小呈正相关。TaGW8-B1等位基因的分布表明,TaGW8-B1a在中国小麦中已被积极选择。
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