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Sunflower pan-genome analysis shows that hybridization altered gene content and disease resistance

向日葵的泛基因组分析

关键词:
来源:
Nature Plants
全文链接1:
http://agri.ckcest.cn/topic/downloadFile/ebee7066-9394-4d3a-991e-944d0a9629d5
全文链接2:
类型:
前沿资讯
语种:
中文
原文发布日期:
2018-12-31
摘要:
驯化的动物和植物通常对于选择的响应有所差异,但人们对其中所隐藏的遗传多样性还了解甚少。栽培种向日葵具有非常高的遗传变异,可能是由于栽培种和近缘野生种的杂交所导致的。为了了解向日葵中的遗传多样性以及向日葵野生近缘种对于栽培种遗传资源的贡献,来自以色列的科学家对287个栽培种品系、17个美国地方种以及代表了11个向日葵野生近缘种的189个个体进行了重测序分析。研究人员将栽培种每个基因型重测序数据未能比对到向日葵参考基因组上的序列进行了从头组装,以获得全部栽培种向日葵的基因库,也就是泛基因组信息。通过对组装的栽培种的基因与野生近缘种的基因进行比较,以确定基因的起源。结果显示,向日葵栽培种泛基因组总共61205个基因,其中27%在不同基因型之间存在变异。大约10%的栽培种泛基因组来自于野生近缘种的渗入,而1.5%的基因来自于基因渗入。基因本体富集分析进一步揭示了在基因渗入区域显著富集了与生物抗性相关的一些基因,这与育种实践中所观察到的现象一致。霜霉病抗性相关的等位基因变异分析作为一个鲜明的例子,说明了基因渗入在提升向日葵对某些日益严重的疾病抗性方面发挥重要作用。
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